More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0058 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  100 
 
 
338 aa  669  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 
353 aa  216  6e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.39 
 
 
335 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.63 
 
 
330 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 
334 aa  196  5e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 
330 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 
339 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 
342 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  9.20501e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 
353 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 
332 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.9 
 
 
342 aa  185  1e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.04 
 
 
336 aa  179  6e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.94 
 
 
333 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 
337 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 
346 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 
332 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.03 
 
 
331 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.69 
 
 
347 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
334 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
342 aa  175  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 
346 aa  175  1e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 
352 aa  174  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 
333 aa  173  4e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  7.82419e-07 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 
327 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.12 
 
 
334 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 
348 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32 
 
 
328 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 
356 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 
334 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.93 
 
 
333 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  36.97 
 
 
335 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36 
 
 
349 aa  167  3e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.7 
 
 
331 aa  167  3e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.89 
 
 
338 aa  167  3e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 
340 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.42 
 
 
330 aa  166  6e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 
347 aa  166  6e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 
336 aa  166  7e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  34.86 
 
 
349 aa  165  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.83 
 
 
338 aa  164  1e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 
337 aa  165  1e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.61 
 
 
334 aa  165  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  36.83 
 
 
323 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30 
 
 
334 aa  164  2e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.36 
 
 
337 aa  164  2e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  36.83 
 
 
323 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.92 
 
 
338 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.94 
 
 
341 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.81496e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  36.11 
 
 
343 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  35.31 
 
 
323 aa  163  4e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  36.51 
 
 
323 aa  163  4e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  38.1 
 
 
348 aa  162  5e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  6.57853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6931  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 
315 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 
333 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 
326 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 
355 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 
329 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 
323 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.49 
 
 
338 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  1.74135e-05 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 
346 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  36.19 
 
 
323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 
342 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  36.19 
 
 
323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  36.19 
 
 
323 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  35.87 
 
 
323 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 
333 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  1.8406e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  35.01 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 
332 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 
339 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 
334 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 
333 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  4.003e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 
326 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1273  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 
326 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.56 
 
 
323 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.1059e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.32 
 
 
334 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 
345 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0280  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 
346 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.2 
 
 
331 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.73 
 
 
334 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 
328 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  28.91 
 
 
332 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.2 
 
 
332 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 
342 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 
349 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 
326 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.2 
 
 
332 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
331 aa  156  5e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 
340 aa  156  5e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.74 
 
 
332 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.52618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  28.91 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  28.91 
 
 
332 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 
349 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.14 
 
 
332 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.03 
 
 
342 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 
337 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 
333 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.75 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
359 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 
337 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  28.61 
 
 
332 aa  154  3e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>