20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0057 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  996  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  42.93 
 
 
373 aa  287  3e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  43.23 
 
 
370 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  41.88 
 
 
361 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  36.48 
 
 
371 aa  226  5e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  34.31 
 
 
398 aa  217  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  36.8 
 
 
396 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  31.57 
 
 
363 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  35.03 
 
 
370 aa  174  2e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  31.14 
 
 
384 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  31.73 
 
 
379 aa  156  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  49.68 
 
 
357 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  31.28 
 
 
361 aa  148  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  29.9 
 
 
368 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  30.92 
 
 
361 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  29.89 
 
 
360 aa  129  9e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  30.23 
 
 
541 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  27.15 
 
 
326 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  33.07 
 
 
594 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  29.48 
 
 
930 aa  71.6  3e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>