29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0051 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  36.67 
 
 
373 aa  140  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  40.77 
 
 
346 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  31.39 
 
 
387 aa  71.6  1e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  36.96 
 
 
684 aa  61.2  2e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  33.1 
 
 
1150 aa  61.2  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  35.87 
 
 
353 aa  59.7  5e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
502 aa  57.8  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  25.83 
 
 
447 aa  56.2  5e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12995e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  27.56 
 
 
397 aa  55.8  7e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 
508 aa  54.7  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  34.74 
 
 
334 aa  53.9  3e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 
362 aa  53.5  4e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  1.16337e-07  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  28.21 
 
 
334 aa  52.4  8e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  40 
 
 
2216 aa  52.4  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 
500 aa  51.2  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 
522 aa  50.8  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  39.42 
 
 
526 aa  50.8  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  32.26 
 
 
593 aa  49.7  5e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  29.52 
 
 
342 aa  49.3  6e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  33.66 
 
 
389 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  32.98 
 
 
419 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  28.23 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 
1427 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  25.17 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  36.23 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  23.81 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  22.58 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.11873e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>