272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0048 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  56.5 
 
 
231 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 
236 aa  173  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  49.42 
 
 
232 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  51.18 
 
 
232 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 
224 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
218 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  42.69 
 
 
249 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
222 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
224 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  46.78 
 
 
219 aa  146  2e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  43.79 
 
 
222 aa  144  7e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 
226 aa  144  8e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  45.03 
 
 
226 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  43.53 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  46.86 
 
 
215 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
232 aa  140  1e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  48.86 
 
 
233 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  44.19 
 
 
221 aa  134  1e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 
225 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
236 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  39.89 
 
 
227 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
216 aa  108  4e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  44.71 
 
 
245 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 
236 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
224 aa  89  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  34.73 
 
 
235 aa  77.8  9e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
217 aa  63.9  1e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.43 
 
 
226 aa  62  5e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
230 aa  60.8  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 
245 aa  60.8  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
234 aa  60.1  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
247 aa  60.5  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
229 aa  59.7  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
244 aa  58.5  6e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
233 aa  58.2  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
233 aa  58.2  7e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
233 aa  58.2  7e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.58 
 
 
249 aa  58.2  9e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
396 aa  57.8  9e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 
227 aa  57.4  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  33.07 
 
 
227 aa  57.4  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
243 aa  57.4  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
233 aa  57  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
267 aa  57  2e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.81 
 
 
222 aa  55.8  3e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 
249 aa  55.8  4e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  36.8 
 
 
207 aa  55.8  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
241 aa  55.8  4e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  32.03 
 
 
250 aa  55.8  4e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
222 aa  55.5  5e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
234 aa  54.7  8e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 
218 aa  54.3  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
202 aa  53.9  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
234 aa  54.3  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 
244 aa  54.3  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  9.51338e-07 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
231 aa  53.1  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
247 aa  53.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
234 aa  53.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 
268 aa  53.5  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 
252 aa  53.5  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 
233 aa  53.9  2e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
234 aa  53.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
245 aa  52.8  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
228 aa  52.8  3e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  24.86 
 
 
229 aa  52.4  4e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
265 aa  52.4  4e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 
252 aa  52.8  4e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
231 aa  52.4  4e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
245 aa  52.4  4e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
237 aa  52.4  5e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
233 aa  52  5e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
222 aa  52  5e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
237 aa  52  5e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
232 aa  52  6e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 
219 aa  51.6  7e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
232 aa  51.6  7e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
225 aa  51.6  8e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
226 aa  50.8  1e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 
246 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
232 aa  51.2  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  33.91 
 
 
210 aa  50.4  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
238 aa  50.8  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 
240 aa  50.4  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
233 aa  50.4  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
239 aa  50.1  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
228 aa  50.1  2e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  34.03 
 
 
242 aa  50.1  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
252 aa  50.4  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
242 aa  49.7  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
268 aa  50.1  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>