More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0044 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.96 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.55 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.49 
 
 		 663 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  40.73 
 
 		 662 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42.8 
 
 		 661 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.28 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.5 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.52 
 
 		 662 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  41.49 
 
 		 651 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.17 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.55 
 
 		 659 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.52 
 
 		 662 aa  165  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.28 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.33 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.4 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  39.92 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  37.76 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.35 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.9 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.06 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.06 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.87 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  41.2 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.4 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35.54 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.54 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>