More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0043 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
290 aa  578  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
270 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
270 aa  199  4e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.44 
 
 
302 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 
290 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
298 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 
269 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
311 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
306 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.45 
 
 
277 aa  189  6e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.86 
 
 
312 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.43 
 
 
279 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  1.84258e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
273 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
272 aa  184  1e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.73 
 
 
272 aa  184  1e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  36.03 
 
 
281 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.4 
 
 
271 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
271 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  39 
 
 
276 aa  180  3e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
291 aa  179  6e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
310 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  32.84 
 
 
277 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  36.9 
 
 
273 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
275 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  36.02 
 
 
292 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  35.11 
 
 
293 aa  174  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
294 aa  174  1e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
299 aa  173  2e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
308 aa  173  3e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
275 aa  173  4e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
292 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.843262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.49 
 
 
278 aa  172  7e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
283 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
293 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
278 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
390 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
280 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  35.36 
 
 
277 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.91 
 
 
278 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
282 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.75 
 
 
306 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
295 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
280 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
281 aa  166  3e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
292 aa  166  3e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  9.34569e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
278 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
284 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
283 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
298 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
292 aa  165  7e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.924355  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.86 
 
 
306 aa  165  7e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  32.85 
 
 
276 aa  165  7e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  38.86 
 
 
287 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
349 aa  165  1e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59414  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
304 aa  164  1e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
299 aa  165  1e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
349 aa  164  1e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
278 aa  164  2e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
303 aa  164  2e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
275 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
286 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
278 aa  162  4e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.82 
 
 
304 aa  162  5e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
289 aa  162  8e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
279 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  7.02238e-05  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 
275 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
298 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
274 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
296 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
295 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  33.1 
 
 
308 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 
273 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
289 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 
273 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
299 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
280 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.26 
 
 
297 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.99 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
307 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  28.99 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
271 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  28.99 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
275 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.99 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
273 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
274 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330294  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
281 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 
273 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
324 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
295 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
288 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.98 
 
 
280 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
300 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
287 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  33.09 
 
 
275 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44305e-12  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  28.62 
 
 
273 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
300 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>