More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0042 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
331 aa  662  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
310 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
317 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  34.89 
 
 
289 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
318 aa  175  1e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  4.73727e-07  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
307 aa  173  3e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
309 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
307 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
300 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
307 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 
307 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
362 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
288 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
300 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
299 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
294 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
307 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.96099e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.23 
 
 
275 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
305 aa  167  3e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
283 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
309 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
294 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.58297e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.44 
 
 
317 aa  166  6e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
310 aa  166  6e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
315 aa  165  1e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  37.23 
 
 
322 aa  164  2e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
313 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
292 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
316 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  32.42 
 
 
321 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
303 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
316 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
295 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
314 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  35.96 
 
 
305 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
316 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
312 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
312 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
308 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.61706e-07  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
319 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  36.08 
 
 
311 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
313 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
291 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
314 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
310 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
319 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.66 
 
 
293 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
316 aa  156  5e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
305 aa  156  5e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
313 aa  156  5e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
299 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
313 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
315 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.71 
 
 
304 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7592  ABC transporter  34.63 
 
 
306 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.11 
 
 
310 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
294 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
306 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
316 aa  153  3e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
309 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
314 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  31.7 
 
 
315 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
305 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
296 aa  152  6e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
320 aa  152  6e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
317 aa  152  6e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
321 aa  152  9e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
296 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.92628e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
290 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 
311 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
300 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
293 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
306 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
306 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
300 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
310 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
299 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
317 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
305 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
308 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
315 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
309 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.25465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
285 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.6 
 
 
300 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
298 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
301 aa  149  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
291 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.86 
 
 
302 aa  148  1e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
308 aa  148  1e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
324 aa  148  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.04062e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
319 aa  148  1e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
316 aa  148  1e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
310 aa  148  1e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
314 aa  147  2e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
350 aa  147  2e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344745  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.8 
 
 
310 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
310 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
306 aa  146  4e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
321 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>