More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0038 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0038  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  56.77 
 
 
244 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5739  hypothetical protein  51.05 
 
 
252 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1697  hypothetical protein  49.57 
 
 
238 aa  233  2e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  50.87 
 
 
238 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  9.95564e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4892  hypothetical protein  53.14 
 
 
239 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  0.298097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5272  hypothetical protein  48.73 
 
 
239 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.132847  normal  0.0555869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4023  hypothetical protein  48.72 
 
 
241 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5710  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0298234  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6248  hypothetical protein  50.86 
 
 
241 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731942  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  50 
 
 
237 aa  224  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4463  hypothetical protein  49.13 
 
 
241 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5056  hypothetical protein  48.93 
 
 
241 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3405  hypothetical protein  51.1 
 
 
236 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0540  hypothetical protein  47.64 
 
 
239 aa  220  1e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  48.07 
 
 
239 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3344  hypothetical protein  45.49 
 
 
241 aa  215  6e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.460481  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5409  hypothetical protein  47.64 
 
 
236 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  hitchhiker  0.00250066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.74 
 
 
240 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5347  hypothetical protein  47.17 
 
 
236 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.78302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2625  hypothetical protein  43.67 
 
 
234 aa  178  6e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572906  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2959  hypothetical protein  43.42 
 
 
237 aa  172  3e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2637  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0592932  hitchhiker  0.000885081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2831  hypothetical protein  43.86 
 
 
237 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.413458  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3418  hypothetical protein  45.1 
 
 
237 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2471  hypothetical protein  42.73 
 
 
240 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1888  hypothetical protein  43.17 
 
 
233 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0375  hypothetical protein  44.05 
 
 
234 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.416346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3140  hypothetical protein  40.71 
 
 
239 aa  164  1e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4131  hypothetical protein  43.12 
 
 
232 aa  164  1e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3441  hypothetical protein  42.51 
 
 
240 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6174  hypothetical protein  42.92 
 
 
232 aa  163  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0498919  normal  0.11518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3086  hypothetical protein  42.51 
 
 
240 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.565993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  41.67 
 
 
509 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  41.67 
 
 
509 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  41.67 
 
 
529 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  39.13 
 
 
505 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1552  hypothetical protein  43.2 
 
 
236 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1637  hypothetical protein  43.28 
 
 
239 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  39.74 
 
 
489 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  43.32 
 
 
545 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12897  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2056  hypothetical protein  40.76 
 
 
238 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  0.33839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0869  hypothetical protein  46.96 
 
 
508 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570323  normal  0.158902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19980  hypothetical protein  38.1 
 
 
532 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0731  hypothetical protein  41.81 
 
 
240 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4512  hypothetical protein  38.3 
 
 
258 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4683  hypothetical protein  42.67 
 
 
233 aa  127  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  33.19 
 
 
275 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  37.13 
 
 
281 aa  121  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3664  hypothetical protein  30.49 
 
 
248 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  29.57 
 
 
247 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.12 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  33 
 
 
229 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  33.83 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  35.35 
 
 
233 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  35.47 
 
 
224 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  33.99 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.15 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.44 
 
 
427 aa  85.5  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  32.58 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  32.61 
 
 
227 aa  84.7  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4448  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 
236 aa  83.2  3e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2742  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 
216 aa  82  7e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.7 
 
 
208 aa  82  8e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  36.57 
 
 
224 aa  81.6  9e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  30.85 
 
 
246 aa  81.3  1e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.86 
 
 
232 aa  80.5  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  33.33 
 
 
216 aa  80.1  3e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  26.63 
 
 
192 aa  79.7  4e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.37 
 
 
413 aa  79.3  5e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  30.1 
 
 
227 aa  79.3  5e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.41 
 
 
224 aa  79  7e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.27 
 
 
225 aa  78.6  7e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
225 aa  78.2  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.89 
 
 
236 aa  78.2  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2323  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
247 aa  77  2e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.291165  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.94 
 
 
232 aa  77.4  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  31.89 
 
 
224 aa  76.6  3e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  37.9 
 
 
237 aa  76.6  3e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  32.61 
 
 
140 aa  76.6  4e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  31.53 
 
 
227 aa  75.5  6e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  33.65 
 
 
227 aa  75.5  6e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 
225 aa  75.9  6e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  35.82 
 
 
224 aa  75.5  7e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.81 
 
 
428 aa  75.5  7e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  33.87 
 
 
228 aa  75.1  9e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  32.86 
 
 
428 aa  74.3  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 
229 aa  74.7  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  30.6 
 
 
212 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  30.11 
 
 
224 aa  73.2  3e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  32.67 
 
 
231 aa  73.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.44 
 
 
429 aa  73.2  4e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.41 
 
 
428 aa  73.2  4e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.25 
 
 
212 aa  72.8  4e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2262  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.33 
 
 
224 aa  72.8  4e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.34 
 
 
205 aa  72.4  5e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1837  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 
223 aa  72  7e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>