More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0036 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
543 aa  1080  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  53.02 
 
 
543 aa  518  1e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  50.92 
 
 
560 aa  494  1e-138  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.71 
 
 
552 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.59 
 
 
551 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  38.9 
 
 
552 aa  339  6e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  38.41 
 
 
555 aa  337  3e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  39.08 
 
 
572 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  1.36096e-06  unclonable  1.6429e-08 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  36.63 
 
 
564 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  36.38 
 
 
561 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  38.98 
 
 
557 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  37.77 
 
 
548 aa  332  7e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  37.68 
 
 
552 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  37.52 
 
 
549 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.43 
 
 
570 aa  329  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  37.94 
 
 
552 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  36.45 
 
 
575 aa  328  1e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  37 
 
 
558 aa  328  2e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.11 
 
 
568 aa  326  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  36.56 
 
 
580 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  38.64 
 
 
565 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  39.81 
 
 
576 aa  324  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  38.03 
 
 
565 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  36.76 
 
 
550 aa  322  9e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  36.88 
 
 
575 aa  320  4e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  36.12 
 
 
564 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  3.06468e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  38.14 
 
 
566 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  38.84 
 
 
581 aa  319  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  36.92 
 
 
538 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  37.29 
 
 
559 aa  315  2e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  36.54 
 
 
572 aa  314  3e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.45 
 
 
572 aa  312  8e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.86 
 
 
559 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  37.57 
 
 
574 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  37.43 
 
 
559 aa  311  3e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  38.07 
 
 
582 aa  311  3e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  37.32 
 
 
553 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  310  6e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  37.02 
 
 
556 aa  309  7e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  36.26 
 
 
570 aa  309  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  38.19 
 
 
567 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  38.71 
 
 
564 aa  307  4e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  37.57 
 
 
572 aa  305  9e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  37.45 
 
 
567 aa  305  2e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  34.45 
 
 
556 aa  303  6e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  37.48 
 
 
567 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  37.48 
 
 
567 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  37.48 
 
 
567 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  37.13 
 
 
567 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  37.27 
 
 
567 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  37.61 
 
 
567 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  37.55 
 
 
567 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  37.07 
 
 
559 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  36.23 
 
 
559 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  37.64 
 
 
561 aa  287  3e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  35.2 
 
 
561 aa  287  3e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  36.21 
 
 
566 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  36.47 
 
 
567 aa  285  2e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  36.47 
 
 
567 aa  285  2e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  34.55 
 
 
567 aa  285  2e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  35.12 
 
 
558 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  38.04 
 
 
558 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  33.58 
 
 
551 aa  276  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.84 
 
 
587 aa  273  4e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  34.3 
 
 
568 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.9 
 
 
555 aa  263  5e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  34.04 
 
 
583 aa  263  7e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.55 
 
 
587 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  31.55 
 
 
587 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  35.02 
 
 
567 aa  255  2e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.53 
 
 
563 aa  254  4e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.4 
 
 
556 aa  253  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.07 
 
 
557 aa  251  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.07 
 
 
562 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
562 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
581 aa  250  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.76 
 
 
587 aa  249  8e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.01 
 
 
569 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.68 
 
 
581 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.2 
 
 
566 aa  247  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.85 
 
 
573 aa  245  2e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  29.64 
 
 
555 aa  244  4e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.53 
 
 
574 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 
566 aa  243  8e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.09 
 
 
574 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.76 
 
 
565 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  28.75 
 
 
573 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
564 aa  241  3e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.34 
 
 
566 aa  241  3e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.32944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.49 
 
 
574 aa  241  3e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
561 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.73 
 
 
552 aa  240  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.08 
 
 
573 aa  240  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  30.78 
 
 
574 aa  239  6e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.71 
 
 
563 aa  239  6e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>