More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0033 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
305 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  40.2 
 
 
320 aa  196  5e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  41.2 
 
 
311 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  35.71 
 
 
317 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  36.39 
 
 
317 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  38.38 
 
 
307 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  32.89 
 
 
303 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 
301 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  34.81 
 
 
299 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.48 
 
 
308 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.7 
 
 
307 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  31.16 
 
 
312 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.13 
 
 
313 aa  111  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  30.31 
 
 
319 aa  109  4e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
291 aa  109  7e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
290 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  31.61 
 
 
301 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
290 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.81 
 
 
292 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.87 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.38 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.39 
 
 
311 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.08 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.42 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.74 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5345  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.67 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
309 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.42 
 
 
303 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.18 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.24 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.42 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.27 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  2.42674e-09 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.42 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1117  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.97 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.86 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.4 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.81 
 
 
305 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 
307 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 
290 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.72 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.81 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.81 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.85 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  24.39 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.73 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  26.51 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 
303 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.28 
 
 
312 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.28 
 
 
312 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  24.39 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.85 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.01 
 
 
297 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0827  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.09 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0328842  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
298 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.16742e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.67 
 
 
305 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
296 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.0244e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  24.04 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
294 aa  84.7  2e-15  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.67 
 
 
305 aa  84.7  2e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  25.42 
 
 
303 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.87 
 
 
303 aa  84.3  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  9.52381e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
293 aa  84  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 
289 aa  84  3e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.08 
 
 
303 aa  84.3  3e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 
296 aa  84.3  3e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
292 aa  84  3e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 
303 aa  84  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 
314 aa  84  3e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
286 aa  83.6  4e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  25.63 
 
 
292 aa  83.2  5e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>