More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0032 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0032  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
532 aa  1051  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  29.83 
 
 
542 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  32.06 
 
 
528 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  28.62 
 
 
534 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.92 
 
 
566 aa  198  2e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  31.41 
 
 
538 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  30.34 
 
 
529 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  32.23 
 
 
541 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04171e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.06 
 
 
543 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.21 
 
 
540 aa  190  6e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  30.04 
 
 
532 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.31 
 
 
562 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  28.71 
 
 
532 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.04 
 
 
566 aa  185  2e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  6.05931e-05 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.76 
 
 
542 aa  181  3e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  28.31 
 
 
538 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  31.19 
 
 
522 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.98 
 
 
539 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.35 
 
 
542 aa  176  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  28.77 
 
 
579 aa  176  1e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  34.45 
 
 
548 aa  176  1e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  28.16 
 
 
576 aa  175  2e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  29.93 
 
 
565 aa  175  2e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.01 
 
 
546 aa  175  2e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  28.65 
 
 
557 aa  173  7e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.85 
 
 
539 aa  173  7e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  32.77 
 
 
556 aa  173  7e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  28.65 
 
 
558 aa  173  8e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  25.97 
 
 
525 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.99 
 
 
542 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  35 
 
 
509 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  31.91 
 
 
550 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  27.77 
 
 
571 aa  170  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.42 
 
 
626 aa  170  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  35.42 
 
 
509 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.61 
 
 
638 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  28.31 
 
 
556 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 
512 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  29.62 
 
 
533 aa  168  3e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  29.46 
 
 
515 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.38 
 
 
552 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  26.23 
 
 
531 aa  166  1e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.48 
 
 
644 aa  165  1e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  30.66 
 
 
529 aa  166  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  30.66 
 
 
529 aa  166  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  27.03 
 
 
535 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.77 
 
 
539 aa  164  4e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  29.88 
 
 
598 aa  163  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  32.2 
 
 
534 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.09 
 
 
623 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  31.93 
 
 
572 aa  163  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  32.67 
 
 
539 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  28.92 
 
 
515 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  27.05 
 
 
531 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 
540 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  27.65 
 
 
576 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  26.24 
 
 
537 aa  160  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  26.8 
 
 
511 aa  160  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  27.92 
 
 
534 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  28.86 
 
 
558 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  29.15 
 
 
609 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  34.64 
 
 
502 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  34.34 
 
 
518 aa  159  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  29.63 
 
 
563 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.7 
 
 
589 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  28.68 
 
 
533 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  29.14 
 
 
534 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.82 
 
 
648 aa  157  5e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.82 
 
 
648 aa  157  5e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.82 
 
 
648 aa  157  5e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  26.99 
 
 
532 aa  157  5e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  26.54 
 
 
531 aa  157  5e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  28.95 
 
 
535 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  31.78 
 
 
537 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  30.34 
 
 
535 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  30.47 
 
 
532 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  29.39 
 
 
557 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  29.17 
 
 
509 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  28.34 
 
 
559 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1373  L-aspartate oxidase  29.21 
 
 
527 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588403  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  28.2 
 
 
552 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  32.34 
 
 
531 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0377  L-aspartate oxidase  27.51 
 
 
431 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  28.24 
 
 
531 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  29 
 
 
646 aa  154  3e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  30.74 
 
 
532 aa  154  3e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  25.67 
 
 
531 aa  154  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.23 
 
 
608 aa  154  3e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  32.68 
 
 
512 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  30.04 
 
 
535 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.33 
 
 
568 aa  154  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.69 
 
 
644 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  29.57 
 
 
509 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  29.85 
 
 
535 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  29.65 
 
 
527 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  29.87 
 
 
523 aa  153  9e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.22 
 
 
566 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  31.82 
 
 
847 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  29.04 
 
 
525 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  29.47 
 
 
574 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>