More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0031 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  100 
 
 
160 aa  327  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  46.94 
 
 
161 aa  132  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  46.26 
 
 
161 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  46.53 
 
 
152 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  46.53 
 
 
152 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  46.53 
 
 
152 aa  129  2e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  45.83 
 
 
152 aa  127  5e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  45.83 
 
 
152 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  44.44 
 
 
153 aa  126  1e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  44.44 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  43.75 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  41.78 
 
 
164 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  45.27 
 
 
160 aa  117  8e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  42.07 
 
 
151 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 
162 aa  114  8e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  41.96 
 
 
151 aa  113  1e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 
157 aa  111  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  42.36 
 
 
156 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  40.41 
 
 
166 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  38.51 
 
 
686 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  41.78 
 
 
149 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  34.84 
 
 
159 aa  89  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  34.25 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
686 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  35.14 
 
 
690 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  33.79 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.56 
 
 
679 aa  84.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  38.36 
 
 
147 aa  84  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  37.04 
 
 
199 aa  84  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  35.62 
 
 
157 aa  83.2  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  36.49 
 
 
148 aa  82.8  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  36 
 
 
169 aa  82  3e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  36.42 
 
 
150 aa  81.6  4e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  35.62 
 
 
150 aa  80.9  6e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  33.33 
 
 
146 aa  80.9  6e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  35.42 
 
 
150 aa  80.5  8e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  35.46 
 
 
141 aa  79.7  1e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  29.45 
 
 
152 aa  80.1  1e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  35.07 
 
 
681 aa  79.3  2e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
681 aa  79.3  2e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  40.19 
 
 
145 aa  79.3  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  36 
 
 
154 aa  79.7  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  36.44 
 
 
132 aa  78.6  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
681 aa  79  3e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
684 aa  78.6  3e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  32.67 
 
 
158 aa  78.6  4e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  35.85 
 
 
168 aa  78.2  5e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
684 aa  78.2  5e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 
156 aa  78.2  5e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  34.64 
 
 
174 aa  77.8  5e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  32.86 
 
 
149 aa  77.8  6e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  34.09 
 
 
147 aa  77.8  6e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  35.76 
 
 
169 aa  77.8  6e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
684 aa  77.8  6e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  35.81 
 
 
149 aa  77.4  7e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  32.62 
 
 
146 aa  77.4  7e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
681 aa  77.4  7e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.11 
 
 
682 aa  77.4  7e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
168 aa  77.4  7e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  37.06 
 
 
153 aa  77.4  8e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1355  acyl dehydratase  35.42 
 
 
142 aa  77.4  8e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  35.56 
 
 
166 aa  76.6  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.01 
 
 
481 aa  75.9  2e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.01 
 
 
481 aa  75.9  2e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.09 
 
 
147 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  37.25 
 
 
175 aa  75.9  2e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  36.15 
 
 
166 aa  75.9  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  34.69 
 
 
149 aa  75.5  3e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  33.56 
 
 
165 aa  75.5  3e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  33.09 
 
 
147 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
695 aa  75.1  4e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  31.97 
 
 
170 aa  74.7  5e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  34.25 
 
 
166 aa  74.7  5e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  35.1 
 
 
161 aa  74.3  6e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  35.17 
 
 
344 aa  74.3  6e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  36.6 
 
 
175 aa  74.3  6e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  35.1 
 
 
161 aa  74.3  6e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  35.1 
 
 
161 aa  74.3  6e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
683 aa  74.3  6e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  36.49 
 
 
156 aa  74.3  6e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  36.55 
 
 
161 aa  73.9  7e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  36 
 
 
164 aa  73.9  8e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  44.23 
 
 
152 aa  73.9  9e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  36.55 
 
 
161 aa  73.9  9e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  34.97 
 
 
148 aa  73.9  9e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  29.66 
 
 
157 aa  73.6  1e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>