More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0024 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
490 aa  1002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  44.08 
 
 
482 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  43.81 
 
 
485 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  43.88 
 
 
480 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.14 
 
 
485 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.19 
 
 
481 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 
483 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  42.25 
 
 
489 aa  363  5e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
485 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.54 
 
 
493 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
483 aa  358  1e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.97 
 
 
487 aa  357  2e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.02 
 
 
491 aa  356  6e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  43.84 
 
 
482 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.14 
 
 
491 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  41.01 
 
 
491 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  41.01 
 
 
491 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  41.01 
 
 
491 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.41 
 
 
480 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  40.88 
 
 
495 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  41.58 
 
 
504 aa  347  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.47 
 
 
484 aa  343  3e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.23 
 
 
489 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.48 
 
 
493 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  40.73 
 
 
491 aa  334  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  39.88 
 
 
485 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.45 
 
 
490 aa  329  5e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  41.35 
 
 
489 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  38.1 
 
 
488 aa  321  2e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  36.93 
 
 
488 aa  320  5e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.54 
 
 
486 aa  305  1e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81199e-05 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
486 aa  302  8e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 
503 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 
501 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.62 
 
 
481 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.97 
 
 
488 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
490 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 
504 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  36.02 
 
 
489 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 
458 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  36.23 
 
 
492 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.5 
 
 
493 aa  243  4e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 
461 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
472 aa  233  7e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
478 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.79 
 
 
471 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
503 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
473 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.59 
 
 
972 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  34.42 
 
 
933 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.53 
 
 
476 aa  215  2e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 
470 aa  214  3e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.01617e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  33.4 
 
 
921 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 
924 aa  199  1e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 
547 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
578 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
577 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
573 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 
610 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
672 aa  181  3e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.15 
 
 
640 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 
701 aa  175  2e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 
954 aa  174  3e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 
570 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  30.61 
 
 
579 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
634 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  7.85776e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
584 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 
611 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.25 
 
 
487 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.1 
 
 
487 aa  166  1e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
689 aa  164  4e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 
651 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 
646 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32 
 
 
641 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
709 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
634 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 
574 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 
645 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
643 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 
647 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.46 
 
 
619 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
691 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.93 
 
 
730 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
662 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
705 aa  152  9e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  29.25 
 
 
645 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
547 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
609 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  29.55 
 
 
713 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 
647 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 
602 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 
602 aa  150  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.51 
 
 
626 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.42 
 
 
695 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 
553 aa  149  2e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 
723 aa  148  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
630 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 
642 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  30.25 
 
 
682 aa  147  4e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
671 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18475e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>