More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0018 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  44.26 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  48.52 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  43.93 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  47.27 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  46.32 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  43.26 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  43.26 
 
 		 289 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  42.91 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  46.55 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  40.48 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  43.32 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  40.51 
 
 		 359 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  42.7 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  42.67 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  39.93 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  41.07 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  40.28 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.97 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  41.67 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  37.79 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  42.16 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  40.59 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  37.85 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  37.83 
 
 		 381 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  43.19 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  38.32 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  36.63 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  38.43 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  43.32 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  38.51 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  36.92 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  34.97 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  41.95 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  35.59 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  40.88 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  35.98 
 
 		 519 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  44.53 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  29.32 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 486 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.98 
 
 		 225 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  30.15 
 
 		 554 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.21 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.91 
 
 		 386 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  33.95 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  33.95 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  38.82 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  40.94 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.3 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  41.89 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  34.44 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  33.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  33.93 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  51.04 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  36.09 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  34.62 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.93 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  27.53 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.24 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  36.42 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.14 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  35 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.11 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  29.68 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  36.49 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.12 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  34.51 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.8 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  37.98 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  35 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  36.49 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  36.23 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  32.65 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  35 
 
 		 172 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  33.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  34.51 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  35.77 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  38.85 
 
 		 197 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  40.15 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  37.66 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  35 
 
 		 172 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  33.72 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  50 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  37.04 
 
 		 541 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>