More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0014 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0014  patatin  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  54.58 
 
 
276 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  53.44 
 
 
276 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  50.89 
 
 
277 aa  252  4e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  53.55 
 
 
277 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  54.35 
 
 
294 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  47.76 
 
 
286 aa  215  6e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  33.1 
 
 
283 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  36.93 
 
 
303 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  36.48 
 
 
306 aa  134  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  36.07 
 
 
306 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  34.85 
 
 
294 aa  129  4e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  33.81 
 
 
313 aa  128  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  34.64 
 
 
314 aa  121  2e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.57 
 
 
312 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  32.1 
 
 
291 aa  115  7e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  40.31 
 
 
306 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  32.16 
 
 
290 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  35.48 
 
 
310 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  29.29 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  35.37 
 
 
357 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  32.65 
 
 
332 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.45 
 
 
347 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35.05 
 
 
345 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.76 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  33.33 
 
 
348 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  34.02 
 
 
343 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  28.63 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  34.54 
 
 
390 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  30.97 
 
 
386 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  33.86 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.75 
 
 
327 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  31.37 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  34.2 
 
 
344 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  30.32 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.32 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  31.63 
 
 
323 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  29.8 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  33.16 
 
 
300 aa  83.2  5e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  30.84 
 
 
335 aa  82.4  7e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  31.28 
 
 
267 aa  82.8  7e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  28.39 
 
 
310 aa  82.4  9e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 
583 aa  82  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  30.11 
 
 
317 aa  82  1e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.17 
 
 
760 aa  80.9  2e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25 
 
 
251 aa  80.1  4e-14  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.65 
 
 
253 aa  79.7  6e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 
765 aa  78.6  1e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  27.62 
 
 
341 aa  78.6  1e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.97 
 
 
250 aa  77.4  2e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.13 
 
 
320 aa  78.2  2e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.37 
 
 
581 aa  77.4  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  30.46 
 
 
312 aa  77.8  2e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  30.41 
 
 
333 aa  78.2  2e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  31.22 
 
 
279 aa  77.4  3e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.34 
 
 
737 aa  77  3e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  30.61 
 
 
1408 aa  76.6  4e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.27 
 
 
334 aa  76.6  4e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  33.15 
 
 
326 aa  76.6  4e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  76.3  5e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.75 
 
 
343 aa  76.3  5e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  29.23 
 
 
301 aa  75.9  7e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  30.9 
 
 
315 aa  75.9  7e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.12 
 
 
763 aa  75.9  7e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  75.9  8e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  30.9 
 
 
315 aa  75.9  8e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  27.63 
 
 
378 aa  75.5  1e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.17 
 
 
324 aa  74.7  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.81 
 
 
737 aa  75.1  1e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  29.32 
 
 
321 aa  74.7  1e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.52 
 
 
738 aa  75.5  1e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  30.81 
 
 
738 aa  75.1  1e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.66561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  30.81 
 
 
738 aa  75.1  1e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  3.04178e-12 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.29 
 
 
740 aa  75.1  1e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  29.52 
 
 
334 aa  75.1  1e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.52 
 
 
735 aa  75.1  1e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.42 
 
 
748 aa  75.5  1e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.41 
 
 
318 aa  74.7  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.13 
 
 
739 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  33.33 
 
 
322 aa  74.3  2e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.66 
 
 
738 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.81 
 
 
738 aa  74.7  2e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.66 
 
 
738 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  28.84 
 
 
315 aa  74.3  2e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  30.88 
 
 
347 aa  74.3  2e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  28.08 
 
 
400 aa  74.7  2e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  30.57 
 
 
327 aa  74.7  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.73316e-05  decreased coverage  3.13207e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  73.6  3e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  31.03 
 
 
387 aa  73.6  4e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  27.7 
 
 
754 aa  73.6  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  34.15 
 
 
352 aa  73.2  4e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1844  patatin-like protein of phospholipase family protein  26.9 
 
 
291 aa  72.8  6e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  32.69 
 
 
776 aa  72.8  6e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  31.13 
 
 
335 aa  72.8  6e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  30.88 
 
 
331 aa  72.8  6e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.33 
 
 
736 aa  72.4  7e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.77 
 
 
777 aa  72.8  7e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  29.35 
 
 
382 aa  72.8  7e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  34.15 
 
 
352 aa  72.4  8e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  27.46 
 
 
804 aa  72.4  9e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>