43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0013 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  33.64 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  35.65 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  38.54 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  35.04 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  43.24 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  37.62 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  34.38 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  36.11 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  35.71 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  32.69 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  39.6 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  47.06 
 
 
114 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  31.78 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  46.81 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  34.29 
 
 
114 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  36.56 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  35.87 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  36.27 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  36.27 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  36.27 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  27.55 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  34.92 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  41.51 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  27.36 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5237  hypothetical protein  32.5 
 
 
188 aa  43.9  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  29.79 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  36.84 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  35.38 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  22.34 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  34.04 
 
 
97 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  28.3 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>