38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0008 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  338  3e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  43.66 
 
 
245 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  50.41 
 
 
171 aa  121  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  49.59 
 
 
135 aa  119  2e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  54.17 
 
 
178 aa  119  2e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0008  putative FHA domain containing protein  49.59 
 
 
331 aa  119  2e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  44.12 
 
 
275 aa  117  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  45.83 
 
 
128 aa  114  7e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.31576e-15 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0008  hypothetical protein  40.99 
 
 
215 aa  111  4e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  40.25 
 
 
166 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  46.27 
 
 
305 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  49.62 
 
 
302 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  46.09 
 
 
288 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  48.57 
 
 
308 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  42.86 
 
 
274 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  39.39 
 
 
645 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  35.66 
 
 
230 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  37.3 
 
 
228 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  40.15 
 
 
290 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  47.86 
 
 
248 aa  99  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  40.15 
 
 
290 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  40.15 
 
 
290 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  39.55 
 
 
301 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  42.4 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  37.7 
 
 
252 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  37.9 
 
 
304 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00120  hypothetical protein  42.28 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  40.44 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  41.38 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0008  hypothetical protein  41.22 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  34.68 
 
 
237 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  40.74 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  36.81 
 
 
232 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  35.38 
 
 
162 aa  78.6  4e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  32.79 
 
 
316 aa  76.6  2e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0039  hypothetical protein  35.61 
 
 
221 aa  75.1  5e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0009  hypothetical protein  37.38 
 
 
107 aa  55.5  3e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>