More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0007 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  42.45 
 
 		 875 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  42.12 
 
 		 875 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0461  DNA gyrase subunit A  41.38 
 
 		 833 aa  654    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  42.01 
 
 		 809 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  45.24 
 
 		 857 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  41.18 
 
 		 859 aa  660    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  42.43 
 
 		 815 aa  693    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  43.03 
 
 		 893 aa  725    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  43.48 
 
 		 860 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  41.92 
 
 		 885 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  45.48 
 
 		 823 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  40.11 
 
 		 908 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1171  DNA gyrase subunit A  41.74 
 
 		 862 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  44.27 
 
 		 819 aa  693    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  42.49 
 
 		 922 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  40.4 
 
 		 919 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  45.48 
 
 		 823 aa  730    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  45.48 
 
 		 823 aa  730    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  45.6 
 
 		 823 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  40.5 
 
 		 866 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.45 
 
 		 863 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  42.45 
 
 		 863 aa  689    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  42.57 
 
 		 879 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  64.38 
 
 		 848 aa  1137    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  43.72 
 
 		 872 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  42.08 
 
 		 883 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  42.43 
 
 		 949 aa  714    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  42.89 
 
 		 849 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  41.49 
 
 		 913 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  43.56 
 
 		 872 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  40.39 
 
 		 866 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  42.55 
 
 		 846 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  42.4 
 
 		 887 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  42.47 
 
 		 907 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  43.94 
 
 		 835 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 		 867 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  45.02 
 
 		 815 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  44.39 
 
 		 886 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  44.69 
 
 		 828 aa  722    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  45.1 
 
 		 865 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  45.28 
 
 		 857 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  42.62 
 
 		 811 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  39.77 
 
 		 871 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  45.48 
 
 		 823 aa  730    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  42.97 
 
 		 863 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  45.82 
 
 		 856 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  42.16 
 
 		 893 aa  685    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  46.78 
 
 		 814 aa  734    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  42.98 
 
 		 907 aa  680    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  62.62 
 
 		 834 aa  1056    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  41.82 
 
 		 839 aa  672    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  42.1 
 
 		 919 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  42.49 
 
 		 886 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  42.82 
 
 		 864 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  40.66 
 
 		 882 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  40.71 
 
 		 908 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  45.52 
 
 		 830 aa  728    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  42.02 
 
 		 907 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  40.95 
 
 		 913 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  42.15 
 
 		 897 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  41.55 
 
 		 865 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  42.67 
 
 		 912 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 		 867 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  59.18 
 
 		 1257 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  48.03 
 
 		 852 aa  761    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  41.23 
 
 		 897 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  41.64 
 
 		 929 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  42.94 
 
 		 865 aa  726    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  44.47 
 
 		 839 aa  752    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.99 
 
 		 839 aa  755    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  41.14 
 
 		 881 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.26 
 
 		 885 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  40.29 
 
 		 946 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  40.29 
 
 		 944 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  42.71 
 
 		 862 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  41.44 
 
 		 909 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  43.13 
 
 		 812 aa  694    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1873  DNA gyrase subunit A  40.43 
 
 		 946 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  41.08 
 
 		 867 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  44.16 
 
 		 836 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  43.19 
 
 		 866 aa  677    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  42.62 
 
 		 829 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  43.45 
 
 		 848 aa  685    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  44.54 
 
 		 817 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  63.54 
 
 		 902 aa  1126    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  41.19 
 
 		 867 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  46.1 
 
 		 796 aa  705    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  45.03 
 
 		 813 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  43 
 
 		 915 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  40.29 
 
 		 918 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  66.59 
 
 		 834 aa  1167    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  43.93 
 
 		 843 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  45.03 
 
 		 827 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 922 aa  1858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1731  DNA gyrase subunit A  40.49 
 
 		 901 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0884555  hitchhiker  0.00443229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  59.18 
 
 		 1257 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  59.46 
 
 		 1262 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  42.66 
 
 		 856 aa  675    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  40.8 
 
 		 856 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  40.86 
 
 		 928 aa  658    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>