56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0005 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  64.8 
 
 
217 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  57.98 
 
 
187 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  59.17 
 
 
173 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  54.61 
 
 
183 aa  138  5e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.07 
 
 
196 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  55.2 
 
 
185 aa  133  1e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  45.95 
 
 
185 aa  132  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  53.6 
 
 
166 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  59.06 
 
 
171 aa  130  1e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  55 
 
 
206 aa  126  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.65 
 
 
196 aa  124  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  52.67 
 
 
188 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  47.2 
 
 
188 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  44.52 
 
 
185 aa  120  1e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  52 
 
 
207 aa  116  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  40.12 
 
 
172 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.62 
 
 
217 aa  114  7e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  43.38 
 
 
190 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  43.38 
 
 
190 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  43.38 
 
 
190 aa  114  1e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  40.26 
 
 
180 aa  112  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  52.8 
 
 
143 aa  113  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  48.12 
 
 
179 aa  111  8e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  46.15 
 
 
184 aa  110  1e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  47.66 
 
 
173 aa  107  9e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  41.54 
 
 
187 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  41.09 
 
 
134 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  39.88 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.19 
 
 
266 aa  97.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  46.15 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  40.56 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  45.76 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  42.65 
 
 
273 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  45.74 
 
 
117 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  31.58 
 
 
155 aa  69.3  3e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  32.38 
 
 
156 aa  65.9  3e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25.35 
 
 
300 aa  50.4  1e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  38.98 
 
 
97 aa  49.3  3e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.92 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  29.89 
 
 
96 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  23.75 
 
 
286 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.92 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  32.67 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  34.69 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  27.47 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  32.61 
 
 
197 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  37.29 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  30.49 
 
 
97 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  40.38 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  30.16 
 
 
101 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  32.26 
 
 
97 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  28.57 
 
 
101 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  35.85 
 
 
97 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  40.38 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>