41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0027 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007483  Noc_A0027  WGR  100 
 
 
86 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  67.53 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  46.58 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  46.38 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  42.47 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  41.43 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  39.44 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  38.57 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  39.13 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  40.85 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  41.67 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  41.67 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  39.13 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  37.33 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  41.43 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  41.43 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  40.58 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  40.58 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  42.03 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  40.58 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  36.71 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  36.84 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  38.57 
 
 
184 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  36.23 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  34.72 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  37.93 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  36.92 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  36.49 
 
 
83 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1085  hypothetical protein  37.7 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  32.47 
 
 
252 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  31.94 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2748  WGR domain-containing protein  37.7 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.393402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  35.29 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  38.89 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  40.85 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  32.31 
 
 
75 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  33.78 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02180  hypothetical protein  32.26 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>