78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3061 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3061  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0975  pentapeptide repeat domain protein  45.95 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000613608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1000  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000366371  unclonable  5.80978e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0677  pentapeptide repeat-containing protein  54.9 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62240  hypothetical protein  48.67 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000219088  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4794  pentapeptide repeat-containing protein  46.85 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103308  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5418  hypothetical protein  48.21 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0625399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0840  pentapeptide repeat-containing protein  44.14 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000049264  decreased coverage  0.0000626764 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  32.53 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  32.53 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.34 
 
 		 14916 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 903 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 446 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  34.18 
 
 		 452 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  33.73 
 
 		 745 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  38.6 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  40.32 
 
 		 973 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 420 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.88 
 
 		 234 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.28 
 
 		 285 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 489 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 862 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  41.51 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  38.16 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  31.51 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  33.93 
 
 		 255 aa  42.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.12 
 
 		 521 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  26.47 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 222 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 408 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  45.83 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 213 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.73 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 		 278 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 		 370 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  35.53 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  31.34 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 		 345 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  33.85 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.41 
 
 		 449 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  35.14 
 
 		 600 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  44.19 
 
 		 234 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 450 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 357 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.31 
 
 		 537 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  44.19 
 
 		 234 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  32.69 
 
 		 273 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 291 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  35.09 
 
 		 563 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  35.09 
 
 		 563 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 291 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 197 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 		 129 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 260 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  30.53 
 
 		 365 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>