More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3049 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  100 
 
 		 113 aa  230  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  52.38 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  50 
 
 		 205 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  55 
 
 		 318 aa  95.9  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  50.94 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  50.56 
 
 		 206 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  46.6 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  51.55 
 
 		 200 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  51.38 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  47.57 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  50.49 
 
 		 206 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  47.87 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  46.39 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  50.96 
 
 		 206 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  50.62 
 
 		 221 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  55 
 
 		 196 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  49.51 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  52.81 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  44.23 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  50.62 
 
 		 205 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  46.32 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  48.98 
 
 		 203 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  53.95 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  46.08 
 
 		 205 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  46.08 
 
 		 205 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  46.08 
 
 		 205 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  54.88 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  48.08 
 
 		 206 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  52.81 
 
 		 205 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  43.12 
 
 		 206 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  52.81 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  53.75 
 
 		 205 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  50.65 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  51.19 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  45.1 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  55 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  46.32 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  54.22 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  44.76 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  48.35 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  41.75 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  47.57 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  47.47 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  46.15 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  53.42 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  45.74 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  48.24 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  45.74 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  40.59 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  53.33 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  44.23 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  44.44 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  44.44 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  48.86 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  42.27 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  53.16 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  54.55 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  54.55 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  50 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  39.66 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  44.55 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  45.26 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  45.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  44.44 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  45.88 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  50 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  40.21 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  43.16 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  47.62 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  42.2 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  42.59 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  48.48 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 266 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  44.3 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  46.99 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  36.84 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  38.83 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  46.99 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>