More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3018 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  100 
 
 
712 aa  1446  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 
734 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.51 
 
 
729 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
736 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  43.71 
 
 
734 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
708 aa  505  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  5.83847e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
816 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
725 aa  466  1e-130  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
718 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
744 aa  440  1e-122  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
710 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  40.72 
 
 
710 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
736 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  39.28 
 
 
705 aa  408  1e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  36.53 
 
 
774 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32996e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.02 
 
 
811 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
812 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
764 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
762 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
762 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
781 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
803 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
800 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
772 aa  363  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
770 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
765 aa  362  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
800 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  35.13 
 
 
806 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
764 aa  359  8e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  35.13 
 
 
787 aa  359  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  35.13 
 
 
802 aa  359  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
775 aa  358  1e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  35.13 
 
 
802 aa  359  1e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  35.13 
 
 
802 aa  359  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  35.13 
 
 
802 aa  359  1e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  35.13 
 
 
802 aa  359  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
776 aa  358  2e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
765 aa  357  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
817 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
804 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  35.13 
 
 
787 aa  355  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
804 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
800 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
804 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
804 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
780 aa  352  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
804 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
756 aa  340  6e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
737 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
738 aa  329  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  6.23284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30.35 
 
 
748 aa  314  4e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
827 aa  314  4e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
733 aa  314  4e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
756 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
756 aa  309  1e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
752 aa  306  8e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19377e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
748 aa  305  1e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
733 aa  305  2e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
731 aa  300  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
823 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
823 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
753 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
741 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
769 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
749 aa  295  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
736 aa  294  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
746 aa  294  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
752 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  30.51 
 
 
767 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  29.69 
 
 
742 aa  281  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
760 aa  281  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
753 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
779 aa  276  1e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
757 aa  276  1e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
759 aa  275  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  30.62 
 
 
774 aa  271  3e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
756 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  31.23 
 
 
759 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
756 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  30.48 
 
 
774 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
771 aa  266  9e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
763 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
754 aa  264  5e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
845 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
756 aa  262  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
747 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
740 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
745 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
756 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
742 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
755 aa  242  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
764 aa  239  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
779 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
768 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  28.7 
 
 
714 aa  238  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
753 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  35.81 
 
 
799 aa  236  1e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
799 aa  235  2e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
784 aa  234  4e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
799 aa  234  4e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>