72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3011 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3011  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0192  hypothetical protein  56.6 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2631  hypothetical protein  53.09 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00025  smg protein  52.53 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2840  hypothetical protein  50.94 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0026  hypothetical protein  51.9 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00388  hypothetical protein  50.63 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0358  hypothetical protein  54 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0362316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0038  hypothetical protein  57.33 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272353  hitchhiker  0.00000478432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0041  hypothetical protein  52.56 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.479355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2325  hypothetical protein  51.23 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.801617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0038  hypothetical protein  53.85 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0240972  normal  0.0588054 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0032  hypothetical protein  56.67 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.263953  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0030  hypothetical protein  56.67 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0078  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0035  smg protein  56.67 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0023  smg protein  51.59 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3733  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0219061  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0027  hypothetical protein  53.21 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002060  hypothetical protein  51.9 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0441  hypothetical protein  53.69 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0035  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0027  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0034  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0030  hypothetical protein  54.49 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0034  protein of unknown function DUF494  54.49 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0027  hypothetical protein  53.21 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1868  hypothetical protein  47.8 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1932  hypothetical protein  47.8 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3966  hypothetical protein  52 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0034  hypothetical protein  51.28 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3787  hypothetical protein  51.3 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00193102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2470  hypothetical protein  48.41 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2089  protein of unknown function DUF494  45.29 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.596862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3600  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4607  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0145872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3580  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0216587  normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3673  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3708  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0588951  normal  0.0775927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3601  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.967939  normal  0.75952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3771  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3767  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000724852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4509  hypothetical protein  49.68 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000588298  hitchhiker  0.000163466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3669  hypothetical protein  49.68 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3716  hypothetical protein  49.04 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195786  hitchhiker  0.0087907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03086  hypothetical protein  49.04 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0429  protein of unknown function DUF494  49.04 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0295235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04052  hypothetical protein  51.66 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0429  hypothetical protein  49.04 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000035196  hitchhiker  0.000953721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03135  hypothetical protein  49.04 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0891254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3478  hypothetical protein  49.04 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000737993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3588  hypothetical protein  49.06 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0046  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.249681  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0318  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0619  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000133668  normal  0.0223362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3880  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000155024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2276  protein of unknown function DUF494  44.79 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580971 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2099  smg protein  43.31 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000321038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0087  hypothetical protein  43.31 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000255352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0075  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0190  hypothetical protein  37.42 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0098  protein of unknown function DUF494  41.35 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0017  protein of unknown function DUF494  33.96 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  0.0565587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0016  smg family protein  33.96 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0280  hypothetical protein  34.19 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4642  hypothetical protein  34.46 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3882  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0347  hypothetical protein  33.55 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0637077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5116  protein of unknown function DUF494  29.05 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3863  hypothetical protein  29.93 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0407  hypothetical protein  30.67 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000667933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0011  Smg protein  31.78 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.222032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>