217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3001 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  351  3e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  45 
 
 
192 aa  155  5e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  47.49 
 
 
192 aa  147  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  42.46 
 
 
197 aa  137  8e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
196 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.44 
 
 
196 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
196 aa  135  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
196 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  42.77 
 
 
182 aa  134  6e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  48.35 
 
 
192 aa  134  6e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  43.86 
 
 
196 aa  133  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 
182 aa  133  2e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  43.27 
 
 
196 aa  132  2e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  42.29 
 
 
182 aa  132  4e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  46.78 
 
 
197 aa  131  7e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  41.71 
 
 
178 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  46.2 
 
 
197 aa  130  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  38.29 
 
 
182 aa  126  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  38.51 
 
 
196 aa  126  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  43.4 
 
 
184 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  39.31 
 
 
182 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.65213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  39.18 
 
 
188 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 
197 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  40.23 
 
 
182 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  8.25612e-07  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002454  membrane protein  39.89 
 
 
185 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  41.01 
 
 
184 aa  120  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  38.86 
 
 
182 aa  120  1e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  40.24 
 
 
180 aa  120  1e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  41.21 
 
 
194 aa  120  1e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  119  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  41.04 
 
 
184 aa  119  2e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.26882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  40.46 
 
 
182 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.45532e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  40.46 
 
 
182 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  2.19253e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.46 
 
 
182 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.91839e-05  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  41.38 
 
 
182 aa  117  1e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  41.24 
 
 
185 aa  116  2e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  40.46 
 
 
182 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.0243e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1330  protein of unknown function YGGT  38.56 
 
 
182 aa  113  1e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  38.86 
 
 
182 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  40.11 
 
 
184 aa  112  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  39.31 
 
 
184 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  40.49 
 
 
180 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  39.77 
 
 
183 aa  110  8e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  35.71 
 
 
188 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74597e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  39.13 
 
 
188 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  41.44 
 
 
184 aa  110  1e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  39.13 
 
 
188 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  39.13 
 
 
188 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  39.13 
 
 
188 aa  110  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  38.29 
 
 
182 aa  109  2e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  35.03 
 
 
180 aa  109  2e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  37.71 
 
 
182 aa  108  7e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  38.51 
 
 
188 aa  107  7e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  43.64 
 
 
184 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  32.39 
 
 
187 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3643  protein of unknown function YGGT  35.84 
 
 
196 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  38.41 
 
 
189 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  39.08 
 
 
184 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  44.51 
 
 
191 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 
184 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  38.18 
 
 
184 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  37.43 
 
 
181 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3642  hypothetical protein  35.63 
 
 
202 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  36.65 
 
 
192 aa  97.8  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.07485e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  36.54 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5573  hypothetical protein  35.47 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  37.72 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  37.72 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  38.46 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616502 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  30.18 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.31673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  33.92 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  33.92 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  33.92 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  34.88 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  34.88 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2416  hypothetical protein  36 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  34.88 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  34.88 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  37.14 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  32.69 
 
 
185 aa  83.2  2e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.5742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  33.54 
 
 
177 aa  83.2  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  33.14 
 
 
187 aa  82.4  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  33.92 
 
 
187 aa  82.4  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  34.29 
 
 
187 aa  79.3  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  34.32 
 
 
186 aa  79.3  3e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1993  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  78.2  6e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1998  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  78.2  7e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  32.52 
 
 
182 aa  76.6  2e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  35.67 
 
 
187 aa  76.6  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  33.14 
 
 
187 aa  75.9  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  33.14 
 
 
187 aa  75.9  3e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>