59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2975 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  100 
 
 		 496 aa  975    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  50.4 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  50.6 
 
 		 537 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  47.63 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  51.29 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  47.63 
 
 		 602 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  51.04 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  50.79 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  51.1 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  50.37 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.54 
 
 		 584 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.34 
 
 		 540 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  47.93 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  47.53 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  50.92 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  45.99 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  47.32 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  47.08 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.56 
 
 		 605 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  47.08 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  65.27 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  65.25 
 
 		 579 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  61.35 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  62.19 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  41.65 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  38.02 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  37.38 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  37.19 
 
 		 386 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  33.23 
 
 		 322 aa  146  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  26.21 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  31.34 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  29.47 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.18 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  32.45 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  25.56 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  30.67 
 
 		 331 aa  67  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  28.12 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  33.58 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  33.58 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  31.21 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  25.68 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  27.04 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.49 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  29.79 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  29.56 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  29.93 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  29.09 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  29.7 
 
 		 361 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  27.27 
 
 		 322 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  27.17 
 
 		 334 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  28.11 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.55 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>