142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2971 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  44.51 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  40.12 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  40.12 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  39.81 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  30.52 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  33.08 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  28.1 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  40.79 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  37 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  35.92 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  37.38 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  37.38 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 316 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  28.81 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  31.62 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  35.11 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  25.86 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  26.55 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  22.99 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  25.41 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  32.63 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 		 367 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  25.15 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 370 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 		 329 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  38.67 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.11 
 
 		 371 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  32.69 
 
 		 349 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  30.48 
 
 		 354 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  38.67 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  25.14 
 
 		 425 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  36.14 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 318 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 346 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  24.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 334 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  31.07 
 
 		 352 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  29.52 
 
 		 434 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.09 
 
 		 338 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 354 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 		 353 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 		 352 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  26.28 
 
 		 334 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 311 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 		 329 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 		 256 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.21 
 
 		 311 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 244 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 372 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 334 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 		 314 aa  47.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  28.85 
 
 		 372 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.56 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 		 378 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 381 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  30.48 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  27.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 300 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>