More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2952 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  100 
 
 
568 aa  1119    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  51.84 
 
 
654 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  37.86 
 
 
662 aa  379  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  39.05 
 
 
666 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 
657 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 
674 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  38.43 
 
 
659 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  37.81 
 
 
648 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  34.88 
 
 
649 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  39.26 
 
 
658 aa  331  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 
668 aa  330  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  38.22 
 
 
661 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.46 
 
 
648 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  38.39 
 
 
663 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  38.57 
 
 
663 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 
678 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  36.23 
 
 
650 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 
649 aa  323  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.55 
 
 
669 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.91 
 
 
648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.73 
 
 
669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  38.73 
 
 
669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.73 
 
 
669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.73 
 
 
669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.73 
 
 
669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  38.29 
 
 
667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  35.91 
 
 
648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
668 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
668 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 
668 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  35.91 
 
 
648 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  36.15 
 
 
652 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  37.28 
 
 
656 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  35.79 
 
 
648 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  35.05 
 
 
574 aa  316  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  36.2 
 
 
648 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  36.2 
 
 
648 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.89 
 
 
720 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  35.96 
 
 
649 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  37.41 
 
 
670 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  37.07 
 
 
661 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  37.07 
 
 
661 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 
670 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 
665 aa  312  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.32 
 
 
649 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  38.53 
 
 
667 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  38.65 
 
 
659 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  38.9 
 
 
666 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.41 
 
 
680 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.07 
 
 
655 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  40.03 
 
 
570 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  38.02 
 
 
659 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  37.26 
 
 
664 aa  300  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.26 
 
 
579 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
654 aa  297  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  36.18 
 
 
648 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 
660 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  34.88 
 
 
660 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.26 
 
 
661 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
659 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 
653 aa  292  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.11 
 
 
583 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.33 
 
 
572 aa  290  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 
661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  36.67 
 
 
661 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  36.65 
 
 
661 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 
563 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 
655 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
666 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
629 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  31.75 
 
 
569 aa  278  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  31.92 
 
 
568 aa  278  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 
583 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.87 
 
 
578 aa  276  5e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 
674 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  36.84 
 
 
661 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  35.4 
 
 
597 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 
630 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  35.74 
 
 
595 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
630 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  34.47 
 
 
533 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.68 
 
 
605 aa  264  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
666 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 
632 aa  262  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 
590 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  35.24 
 
 
594 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
672 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 
578 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
593 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  30.31 
 
 
628 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  29.9 
 
 
628 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.52 
 
 
697 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 
658 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
665 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  28.73 
 
 
636 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  30.43 
 
 
616 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.26 
 
 
602 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.26 
 
 
602 aa  250  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.26 
 
 
602 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.53 
 
 
601 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>