More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2895 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  65.23 
 
 
585 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  100 
 
 
580 aa  1173    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  60.5 
 
 
573 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  60.18 
 
 
575 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  58.79 
 
 
566 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  58.79 
 
 
566 aa  609  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  57.37 
 
 
585 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  61.46 
 
 
585 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  54.92 
 
 
563 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  53.86 
 
 
578 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  51.77 
 
 
575 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  53.58 
 
 
559 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  51.44 
 
 
567 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  52.11 
 
 
578 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  46.1 
 
 
599 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.8 
 
 
599 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.93 
 
 
599 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.6 
 
 
558 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.43 
 
 
603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.32 
 
 
871 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  55.64 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.78 
 
 
573 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.57 
 
 
521 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  46.7 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.98 
 
 
568 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.9 
 
 
570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.45 
 
 
568 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.54 
 
 
558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.53 
 
 
568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.42 
 
 
557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.75 
 
 
571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.13 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.02 
 
 
568 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.52 
 
 
568 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  48.97 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 
520 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.54 
 
 
520 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.75 
 
 
566 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.24 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.66 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.81 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.77 
 
 
568 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.09 
 
 
563 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.07 
 
 
563 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.75 
 
 
520 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
571 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.82 
 
 
553 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.43 
 
 
564 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  49.27 
 
 
517 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  50.83 
 
 
503 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.22 
 
 
568 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
570 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  43.4 
 
 
575 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.28 
 
 
568 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.28 
 
 
571 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.33 
 
 
565 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  46.53 
 
 
538 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 
610 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  44.47 
 
 
561 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.5 
 
 
568 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.37 
 
 
553 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.41 
 
 
555 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.5 
 
 
568 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
558 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
606 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  46.12 
 
 
561 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  54.66 
 
 
518 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 
571 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  50.12 
 
 
500 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.59 
 
 
501 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.95 
 
 
514 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  44.65 
 
 
544 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  43.75 
 
 
550 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  50.24 
 
 
499 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.41 
 
 
561 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
576 aa  423  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  48.02 
 
 
569 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
557 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  45.27 
 
 
572 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  49.17 
 
 
549 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
885 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
554 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  50.1 
 
 
557 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
541 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  40.25 
 
 
563 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  45.24 
 
 
500 aa  413  1e-114  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.01 
 
 
564 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
787 aa  415  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  51.15 
 
 
550 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.56 
 
 
520 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.61 
 
 
891 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  54.02 
 
 
469 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  54.02 
 
 
469 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.83 
 
 
570 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  41.03 
 
 
577 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  53.42 
 
 
522 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.72 
 
 
552 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
888 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>