More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2889 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  790    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  45.78 
 
 
613 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
369 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
377 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
367 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
367 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  29.59 
 
 
638 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
385 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  29.87 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
383 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
378 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  30.4 
 
 
381 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
376 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  29.93 
 
 
381 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
377 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  30.73 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
382 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
376 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 
415 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
405 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
396 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.98 
 
 
404 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
384 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
399 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.95 
 
 
383 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
426 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
353 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
384 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
369 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
367 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.26 
 
 
403 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
387 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
361 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
390 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
536 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
400 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
385 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.24 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
420 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
392 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
398 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.29 
 
 
423 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.55 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
370 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.81 
 
 
411 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.28 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.13 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.69 
 
 
406 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
395 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
1080 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
415 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.98 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  31.1 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>