16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2853 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  34.62 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  34.62 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  35.65 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  32.28 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  35.82 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  31.16 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  32.14 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  30.95 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>