More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2852 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  100 
 
 		 315 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  47.92 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.91 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  41.27 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.46 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  43.62 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  43.26 
 
 		 299 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  41.84 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  43.92 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  47.77 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  42.2 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  39.1 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  37.14 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.74 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.74 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  38.46 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  42.51 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  42.13 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  44.96 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  44.96 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  44.96 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.96 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.86 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  46.22 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  44.63 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  36.25 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.6 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.73 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.89 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  40.36 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  39.13 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  39.76 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  38.17 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  35.41 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  34.52 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  46.11 
 
 		 384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  34.95 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  36.44 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  41.67 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  36.89 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.32 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.71 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  33.48 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  29.49 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.05 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  45.26 
 
 		 445 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  49.62 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  41.48 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.99 
 
 		 450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  47.33 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  48.15 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.96 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.39 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  41.67 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  41.98 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  44.96 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.57 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  39.05 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50.85 
 
 		 457 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  29.28 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  51.69 
 
 		 459 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  48.48 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  39.46 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  39.88 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.94 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.99 
 
 		 455 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  36.22 
 
 		 413 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  47.69 
 
 		 233 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.12 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  33.92 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  50.41 
 
 		 656 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.24 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.33 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.31 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.09 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  38.89 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  39.77 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.67 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50.85 
 
 		 455 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.64 
 
 		 282 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.75 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.97 
 
 		 440 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  46.15 
 
 		 439 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  38.43 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.54 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  50.44 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  45.38 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.69 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  46.67 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.09 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.4 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  49.19 
 
 		 482 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  45.31 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  32.44 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>