More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2845 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  100 
 
 
325 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  55.73 
 
 
316 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  54.7 
 
 
312 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  54.64 
 
 
326 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  53.51 
 
 
313 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  54.75 
 
 
326 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.16 
 
 
326 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  53.11 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  52.4 
 
 
350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  52.74 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  52.74 
 
 
364 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  53.47 
 
 
320 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  52.16 
 
 
325 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  51.83 
 
 
311 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  50.96 
 
 
330 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  53.26 
 
 
349 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  52.9 
 
 
387 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  53.79 
 
 
378 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  51.8 
 
 
332 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  53.26 
 
 
333 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.66 
 
 
329 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.19 
 
 
329 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.64 
 
 
329 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  51.86 
 
 
394 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.82 
 
 
341 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  51.99 
 
 
329 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  50.17 
 
 
361 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  50.64 
 
 
333 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  49.68 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  52.6 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  52.6 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  52.6 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  52.6 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  52.6 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  49.03 
 
 
330 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  49.03 
 
 
330 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  49.03 
 
 
330 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  49.83 
 
 
360 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  52.25 
 
 
333 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  47.97 
 
 
311 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  52.07 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  50 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  50.32 
 
 
334 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  50 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  50.34 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  49.68 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  51.9 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  50.81 
 
 
321 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  47.22 
 
 
327 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  50.68 
 
 
348 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  52.76 
 
 
336 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  49.83 
 
 
347 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  46.5 
 
 
329 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  48.56 
 
 
347 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  51.22 
 
 
340 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  48.24 
 
 
347 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  51.38 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  48.39 
 
 
334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.1 
 
 
350 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.9 
 
 
357 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  45.39 
 
 
325 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.48 
 
 
350 aa  271  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  53.33 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  46.05 
 
 
336 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  46.62 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  45.45 
 
 
318 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  44.67 
 
 
351 aa  256  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.67 
 
 
351 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  40.92 
 
 
312 aa  238  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.61 
 
 
339 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  41.2 
 
 
300 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.89 
 
 
313 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  37.89 
 
 
313 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  39.92 
 
 
278 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  44.12 
 
 
267 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  40.09 
 
 
265 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  37.7 
 
 
297 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  39.19 
 
 
300 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  42.86 
 
 
302 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  39.59 
 
 
265 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  41.55 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  38.89 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  42.15 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  42.27 
 
 
288 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  41.1 
 
 
286 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  43.78 
 
 
283 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  39.92 
 
 
265 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  41.59 
 
 
265 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  44.83 
 
 
368 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  44.83 
 
 
368 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  38.8 
 
 
283 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  41.01 
 
 
293 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  45.16 
 
 
290 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  39.5 
 
 
265 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  36.8 
 
 
306 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  41.36 
 
 
295 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  36.43 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  42.78 
 
 
288 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  38.4 
 
 
292 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>