More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2839 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  50.74 
 
 
318 aa  261  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  52.65 
 
 
251 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  48.41 
 
 
287 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  48.18 
 
 
287 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  46.77 
 
 
301 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  45.66 
 
 
301 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  45.9 
 
 
284 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  45.9 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  44.76 
 
 
303 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  45.97 
 
 
289 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  46.12 
 
 
287 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  46.4 
 
 
292 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  43.58 
 
 
297 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  44.4 
 
 
287 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  41.67 
 
 
285 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  42.86 
 
 
288 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  42.48 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  44.08 
 
 
285 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  41.7 
 
 
279 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  43.7 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  44.63 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  41.7 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  41.09 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  41.7 
 
 
288 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  44.21 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  41.82 
 
 
318 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  42.34 
 
 
279 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  41.54 
 
 
299 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  40.78 
 
 
288 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  38.67 
 
 
270 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  43.37 
 
 
291 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  43.67 
 
 
299 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  41.96 
 
 
294 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
292 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
315 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  42.91 
 
 
292 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  40.23 
 
 
292 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  43.15 
 
 
268 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  42.51 
 
 
319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  43.39 
 
 
302 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  42.51 
 
 
319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  42.51 
 
 
319 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  40.39 
 
 
291 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  41.08 
 
 
268 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  38.91 
 
 
288 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  41.08 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  38.43 
 
 
282 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.61 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  43.15 
 
 
279 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  48.28 
 
 
175 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  44.44 
 
 
299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  39.52 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  39.18 
 
 
296 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  45.26 
 
 
282 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  38.49 
 
 
275 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  39.29 
 
 
273 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  40.87 
 
 
283 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  40.15 
 
 
305 aa  165  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  38.67 
 
 
342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  39.18 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  37.84 
 
 
342 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  38.74 
 
 
266 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  36.72 
 
 
229 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  44.44 
 
 
225 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  39.92 
 
 
263 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  46.47 
 
 
332 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  32.96 
 
 
244 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  45.56 
 
 
273 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  45.25 
 
 
262 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  42.77 
 
 
261 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.24 
 
 
267 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  35.47 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  34.21 
 
 
283 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  38.71 
 
 
263 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  35.8 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  36.29 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  36.05 
 
 
229 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  32.47 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  51.02 
 
 
247 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  34.36 
 
 
239 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  37.35 
 
 
241 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.2 
 
 
260 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  37.8 
 
 
255 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  35.92 
 
 
264 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  37.45 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  41.04 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  40.78 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  48.95 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  36.15 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  36.09 
 
 
244 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  34.35 
 
 
243 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.51 
 
 
280 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  37.21 
 
 
242 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  36.51 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  34.51 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  35.54 
 
 
239 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  35.92 
 
 
289 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  34.43 
 
 
278 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>