More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2770 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 618 aa  1268    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  64.57 
 
 		 622 aa  833    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  61.58 
 
 		 619 aa  768    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  31.59 
 
 		 576 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.84 
 
 		 538 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.19 
 
 		 540 aa  243  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 538 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.78 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 533 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 534 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 565 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 539 aa  220  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.34 
 
 		 534 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.03 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 509 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 		 549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 534 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 584 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.98 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.68 
 
 		 594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 524 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.01 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 532 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.49 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.65 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 866 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.77 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 529 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 607 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 595 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.2 
 
 		 516 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 557 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.11 
 
 		 520 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.39 
 
 		 527 aa  150  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.44 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.44 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.93 
 
 		 580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.93 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 573 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.31 
 
 		 545 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 531 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.36 
 
 		 575 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27.04 
 
 		 518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  27.06 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.27 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.1 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.47 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.13 
 
 		 532 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 		 565 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.97 
 
 		 575 aa  144  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 529 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.6 
 
 		 528 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.6 
 
 		 528 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.2 
 
 		 528 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 522 aa  144  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 545 aa  144  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 522 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 575 aa  143  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>