More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2687 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  52.87 
 
 		 611 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  50.29 
 
 		 673 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  50.5 
 
 		 806 aa  738    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 661 aa  1372    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  64.3 
 
 		 655 aa  855    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  76.13 
 
 		 659 aa  1042    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  47.79 
 
 		 673 aa  639    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  58.04 
 
 		 777 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  84.72 
 
 		 658 aa  1156    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  57.85 
 
 		 683 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  78.42 
 
 		 661 aa  1066    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  78.42 
 
 		 661 aa  1072    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  46.1 
 
 		 676 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  45.95 
 
 		 676 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  47.82 
 
 		 670 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.33 
 
 		 680 aa  618  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  49.49 
 
 		 661 aa  621  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  44.65 
 
 		 708 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.72 
 
 		 663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  47.73 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.9 
 
 		 728 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  45.43 
 
 		 659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  59.46 
 
 		 580 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  58.61 
 
 		 675 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  41.75 
 
 		 725 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  46.38 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.07 
 
 		 676 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  44.49 
 
 		 675 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  41.21 
 
 		 709 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  52.78 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.19 
 
 		 644 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.71 
 
 		 586 aa  496  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  48.63 
 
 		 583 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  40 
 
 		 677 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  48.95 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  37.07 
 
 		 783 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  36.33 
 
 		 787 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  38.87 
 
 		 710 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  34.92 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  37.22 
 
 		 636 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  33.67 
 
 		 794 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  39.85 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  33.94 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.99 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  43.85 
 
 		 589 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  44.21 
 
 		 592 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  42.77 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  42.66 
 
 		 793 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  39.17 
 
 		 778 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  34.48 
 
 		 725 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  49.47 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  42.86 
 
 		 790 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  42.54 
 
 		 763 aa  360  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  45.33 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.3 
 
 		 799 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  45.45 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.08 
 
 		 697 aa  206  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.13 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  29.96 
 
 		 574 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.74 
 
 		 587 aa  184  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.21 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.48 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.42 
 
 		 822 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.72 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.72 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  34.44 
 
 		 585 aa  173  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  52.07 
 
 		 356 aa  164  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.73 
 
 		 495 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.96 
 
 		 814 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.21 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.22 
 
 		 815 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 496 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  25.79 
 
 		 908 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  25.97 
 
 		 808 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.19 
 
 		 498 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 530 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 530 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.03 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  24.04 
 
 		 523 aa  138  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.31 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  25.16 
 
 		 526 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.65 
 
 		 499 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 516 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25.47 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  24.59 
 
 		 522 aa  135  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 		 505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  25.39 
 
 		 799 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  25.17 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  25.44 
 
 		 504 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  26.08 
 
 		 824 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  26.06 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>