More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2512 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
177 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  44.38 
 
 
171 aa  140  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
179 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
173 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
281 aa  134  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
176 aa  134  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
173 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.06 
 
 
176 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
186 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
180 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  40.76 
 
 
210 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
184 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
182 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
180 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
177 aa  121  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
213 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
186 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.71 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  35 
 
 
180 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  35 
 
 
180 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 
187 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  39.1 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
164 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
175 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
211 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
204 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 
184 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
169 aa  112  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
180 aa  112  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
179 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  37.04 
 
 
185 aa  111  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.13 
 
 
196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
201 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
166 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
228 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
201 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
184 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.13 
 
 
196 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
211 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.8 
 
 
214 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  35 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
184 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  35.44 
 
 
194 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  34.18 
 
 
176 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
195 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
204 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.48 
 
 
196 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
169 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
196 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  39.39 
 
 
194 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
164 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
186 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  33.54 
 
 
176 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
182 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  39.49 
 
 
207 aa  104  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
178 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
194 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
203 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
216 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  36.14 
 
 
173 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>