286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2504 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  7.07909e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  48.01 
 
 
275 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.79 
 
 
281 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  46.44 
 
 
281 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  51.57 
 
 
279 aa  222  5e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
281 aa  221  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  45.69 
 
 
281 aa  221  1e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
316 aa  220  2e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
316 aa  220  2e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  43.25 
 
 
280 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
316 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  44.94 
 
 
281 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.99 
 
 
284 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  42.55 
 
 
302 aa  214  1e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
454 aa  213  3e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
568 aa  212  5e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  45.99 
 
 
307 aa  212  6e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
281 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
281 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
281 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
281 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  51.72 
 
 
281 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 
235 aa  211  8e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  45.64 
 
 
281 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.53 
 
 
279 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  48.66 
 
 
236 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.67 
 
 
279 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 
285 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.95 
 
 
285 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
236 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  47.49 
 
 
310 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
276 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
279 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
325 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
241 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  44.26 
 
 
296 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 
404 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
325 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
237 aa  190  3e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  48.78 
 
 
325 aa  189  3e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.5 
 
 
237 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.95 
 
 
413 aa  189  6e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  45.97 
 
 
237 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 
298 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  46.4 
 
 
410 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  40.91 
 
 
298 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 
237 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  40.91 
 
 
298 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.05 
 
 
398 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.52134e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  45.18 
 
 
322 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  47.69 
 
 
369 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
326 aa  185  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 
264 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 
326 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 
326 aa  184  1e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 
326 aa  184  1e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  42.73 
 
 
295 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  42.74 
 
 
411 aa  182  5e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  45.49 
 
 
325 aa  181  8e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 
296 aa  181  9e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  46.76 
 
 
322 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 
419 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  44.35 
 
 
322 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  44.39 
 
 
289 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  41.45 
 
 
291 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  45.92 
 
 
400 aa  179  3e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  37.76 
 
 
404 aa  180  3e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
292 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  43.91 
 
 
322 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.8 
 
 
325 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  45.5 
 
 
327 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  40.53 
 
 
299 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.49 
 
 
403 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  42.22 
 
 
297 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 
238 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  46.92 
 
 
238 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.13 
 
 
410 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.49 
 
 
420 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  42.98 
 
 
326 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.32 
 
 
406 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  42.79 
 
 
432 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  42.19 
 
 
326 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  42.6 
 
 
408 aa  175  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  40.09 
 
 
299 aa  175  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  41.13 
 
 
291 aa  174  1e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  41.41 
 
 
296 aa  174  1e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  40.08 
 
 
296 aa  173  2e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
322 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 
296 aa  174  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
226 aa  173  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
322 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
322 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
322 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>