More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2456 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  42.97 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  43.28 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  42.54 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  41.79 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  43.67 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  40.15 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 406 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  39.19 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  39 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  39 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  37.63 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  37.63 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  37.36 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  37.55 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  36.33 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 409 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  38.57 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  38.42 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  38.61 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  38.19 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  37.62 
 
 		 279 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  37.62 
 
 		 279 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  35.81 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  36.63 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  35.78 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  37.13 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  36.95 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  36.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  36.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  36.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  36.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  30.94 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  34.11 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  34.29 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  35.45 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 410 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  28.69 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  30.49 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  28.35 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  32.44 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.09 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.08 
 
 		 730 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 		 408 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  29.13 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.64 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  26.18 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 415 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 455 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.29 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 718 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 425 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  25.96 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.23 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.92 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.7 
 
 		 716 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  25.86 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25.32 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.85 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  29.22 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.11 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  27.67 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.06 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  25.11 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.01 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>