More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2444 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
385 aa  801    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.94 
 
 
387 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  55.56 
 
 
408 aa  434  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 
388 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  54.64 
 
 
383 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  56.54 
 
 
404 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  56.28 
 
 
404 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  54.38 
 
 
383 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  54.47 
 
 
404 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  54.5 
 
 
385 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  54.47 
 
 
404 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  54.47 
 
 
404 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  55.87 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  55.5 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  55 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  54.74 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  54.47 
 
 
409 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  55 
 
 
404 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.99 
 
 
396 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.62 
 
 
382 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  52.36 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  55.61 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.69 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  53.4 
 
 
419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  54.24 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  53.98 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.77 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
392 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.96 
 
 
393 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  55.09 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  53.52 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  52.49 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  52.42 
 
 
401 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  52.24 
 
 
384 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.38 
 
 
419 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  52.38 
 
 
380 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 
384 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 
408 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  52.51 
 
 
386 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.16 
 
 
414 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.73 
 
 
375 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  51.73 
 
 
375 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  52.25 
 
 
384 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  51.97 
 
 
391 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3308  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  55.99 
 
 
390 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  52.23 
 
 
395 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  51.57 
 
 
391 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  52.74 
 
 
407 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 
399 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 
394 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  49.13 
 
 
417 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  49.6 
 
 
385 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  52.38 
 
 
404 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 
379 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.08 
 
 
416 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0703  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.02 
 
 
457 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.625393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 
378 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  52.39 
 
 
373 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  52.12 
 
 
404 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  48.41 
 
 
378 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  48.56 
 
 
392 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.97 
 
 
400 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.41 
 
 
385 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  49.61 
 
 
386 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
388 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.88 
 
 
378 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
388 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
388 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  48.3 
 
 
390 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.41 
 
 
385 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 
391 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 
382 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
385 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.77 
 
 
390 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
388 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  50.66 
 
 
375 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  49.61 
 
 
400 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.42 
 
 
379 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
387 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2448  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  50 
 
 
398 aa  362  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.403351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2303  hypothetical protein  50.13 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  49.61 
 
 
392 aa  362  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
379 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.46 
 
 
388 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0921  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
414 aa  358  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0856  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
414 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  48.28 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2483  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  49.74 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274904  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 
392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
379 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.47 
 
 
389 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.68 
 
 
380 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  48.52 
 
 
380 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
379 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>