More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2423 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 296 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  48.18 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  47.58 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  40.55 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  40.89 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  44.6 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  44.78 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  43.99 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  43.31 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  41.29 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  37.98 
 
 		 323 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  42.12 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  44.44 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  40.14 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  43.33 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  38.33 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  38.33 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.47 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.85 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.5 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  36.3 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  40.3 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  37.85 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  35.23 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  36.71 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  37.92 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  37.33 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  32.53 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.64 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  34.83 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.8 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.15 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.15 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  43.04 
 
 		 469 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  31.8 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  32.96 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.12 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  31.78 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.67 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.57 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.57 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.57 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.67 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.84 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.21 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.24 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.67 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.2 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.45 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.57 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.69 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.69 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.4 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.63 
 
 		 514 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.2 
 
 		 368 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.05 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.44 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.03 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  25 
 
 		 506 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.1 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>