134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2393 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  100 
 
 
321 aa  651  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.6 
 
 
519 aa  149  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  35.23 
 
 
494 aa  148  2e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  43.26 
 
 
508 aa  135  7e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  32.67 
 
 
505 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.38 
 
 
596 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  37.56 
 
 
540 aa  118  1e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.37 
 
 
508 aa  117  2e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  35.61 
 
 
499 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  35.21 
 
 
508 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  35.21 
 
 
508 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  30.07 
 
 
508 aa  115  7e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.3 
 
 
512 aa  115  8e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  35.21 
 
 
508 aa  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  38.28 
 
 
208 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  37.8 
 
 
208 aa  113  4e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  28.65 
 
 
505 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  37.5 
 
 
213 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  38.35 
 
 
498 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  39.25 
 
 
208 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 
512 aa  111  1e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.79 
 
 
508 aa  112  1e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  39.25 
 
 
208 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  37.44 
 
 
508 aa  111  2e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  37.02 
 
 
213 aa  111  2e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  37.02 
 
 
213 aa  111  2e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  37.02 
 
 
213 aa  111  2e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  37.02 
 
 
211 aa  111  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  37.02 
 
 
213 aa  111  2e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  30.24 
 
 
512 aa  111  2e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  37.91 
 
 
503 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  37.5 
 
 
215 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  37.5 
 
 
215 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  43.43 
 
 
207 aa  110  4e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  37.67 
 
 
503 aa  110  4e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  38.86 
 
 
208 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.7 
 
 
511 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  37.5 
 
 
213 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  38.86 
 
 
208 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  29.47 
 
 
510 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.47 
 
 
490 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  32.43 
 
 
529 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  37.22 
 
 
503 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  37.31 
 
 
328 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  35.71 
 
 
503 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  38.86 
 
 
208 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  37.31 
 
 
435 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  37.31 
 
 
435 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.34146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  37.31 
 
 
435 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  34.62 
 
 
487 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 
510 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  33.85 
 
 
315 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  39.72 
 
 
208 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  38.39 
 
 
510 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  39.35 
 
 
454 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  40.3 
 
 
291 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  32.43 
 
 
495 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  28.46 
 
 
502 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  33.65 
 
 
505 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.33 
 
 
495 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.94 
 
 
511 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  35.71 
 
 
500 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  5.03049e-08 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  35.47 
 
 
543 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.6 
 
 
513 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  38.69 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  37.02 
 
 
721 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  37.96 
 
 
454 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.01225e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  39.02 
 
 
433 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.45512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  39.02 
 
 
433 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  38.94 
 
 
206 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  32.36 
 
 
443 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  39.72 
 
 
208 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  35.15 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  34.86 
 
 
500 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  1.93925e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  34.98 
 
 
492 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  35.15 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  37.56 
 
 
286 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  33.33 
 
 
433 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  35.15 
 
 
433 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  35.15 
 
 
433 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  36.89 
 
 
719 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  38.41 
 
 
433 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  38.89 
 
 
454 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  38.43 
 
 
512 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  34.73 
 
 
433 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  32.2 
 
 
494 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  33.79 
 
 
219 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  36.89 
 
 
511 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  31.64 
 
 
435 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  33.17 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  31.15 
 
 
504 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  31.02 
 
 
443 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.74 
 
 
505 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  37.96 
 
 
512 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  35.88 
 
 
514 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>