265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2359 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  100 
 
 
567 aa  1142    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  41.9 
 
 
598 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  42.21 
 
 
592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  42.03 
 
 
592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  42.14 
 
 
597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  42.03 
 
 
592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  41.86 
 
 
594 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  46.11 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  41.61 
 
 
594 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  42.05 
 
 
595 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  46.53 
 
 
567 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  41.86 
 
 
592 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  46 
 
 
552 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  40.14 
 
 
544 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
544 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  41.34 
 
 
594 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  45.4 
 
 
561 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  42.52 
 
 
587 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  43.67 
 
 
600 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  43.42 
 
 
603 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  39.25 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  40.85 
 
 
568 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  42.47 
 
 
593 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  43.79 
 
 
587 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  43.35 
 
 
587 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  43.79 
 
 
587 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  41.32 
 
 
677 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  40.55 
 
 
558 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
587 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
587 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  41.8 
 
 
580 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  43.05 
 
 
587 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  40.73 
 
 
552 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  40.54 
 
 
598 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  40.73 
 
 
552 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  40.73 
 
 
552 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  40.54 
 
 
598 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  40.73 
 
 
552 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  40.54 
 
 
598 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  40.73 
 
 
552 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  40.73 
 
 
552 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  40.36 
 
 
598 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  40.36 
 
 
598 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  40.48 
 
 
568 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  40.36 
 
 
598 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  40.36 
 
 
598 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  41.93 
 
 
548 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  40.43 
 
 
563 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  43.36 
 
 
548 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  38.21 
 
 
590 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  39.3 
 
 
576 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
579 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
579 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  39.6 
 
 
579 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
579 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  39.32 
 
 
611 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  39.4 
 
 
565 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  41 
 
 
574 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  41 
 
 
574 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  42.47 
 
 
567 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  39.9 
 
 
571 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
570 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
570 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
570 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  39.96 
 
 
560 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  38.23 
 
 
611 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  38.23 
 
 
611 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  39.2 
 
 
584 aa  352  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  40.72 
 
 
563 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  38.87 
 
 
586 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  38.38 
 
 
588 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  38.22 
 
 
576 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  40.49 
 
 
562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  42.25 
 
 
566 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  40.37 
 
 
564 aa  333  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  40.37 
 
 
564 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  37.64 
 
 
595 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  38.12 
 
 
566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  38.83 
 
 
569 aa  329  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  37.61 
 
 
568 aa  326  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  38.06 
 
 
569 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  40.73 
 
 
594 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  37.43 
 
 
574 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  34.37 
 
 
568 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  36.12 
 
 
560 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  36.3 
 
 
560 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  35.93 
 
 
560 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  35.93 
 
 
560 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  38.49 
 
 
576 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  36.12 
 
 
560 aa  297  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  35.1 
 
 
566 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  35.15 
 
 
568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  35.58 
 
 
566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  36.2 
 
 
553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  35.74 
 
 
525 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  36.01 
 
 
561 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  36.01 
 
 
561 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  36.01 
 
 
561 aa  280  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  36.62 
 
 
569 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  36.05 
 
 
565 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>