105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2344 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  39.6 
 
 
207 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  36.22 
 
 
207 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  36.22 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  32.65 
 
 
207 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.08 
 
 
205 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.08 
 
 
205 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  32.65 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  32.65 
 
 
207 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  32.81 
 
 
207 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
207 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  31.22 
 
 
220 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  33.85 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  33.16 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  31.44 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  31.44 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  30.57 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  27.37 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  25.85 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  30.61 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  31.38 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  31.91 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.96 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  31.44 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  32.31 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  25.85 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  27.32 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  24.12 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  27.86 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  30.97 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  26.13 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  21.94 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  25.63 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  23.62 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  22.68 
 
 
219 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  29.69 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  27.52 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  27.47 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  26.92 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.52 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  27.5 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  28.02 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  21.24 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  29.87 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  24.76 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  24.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  21.61 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  26.37 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  22.44 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  23.76 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  23.62 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  29.2 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  24.88 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  23.76 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  23.76 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  21.58 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  22.16 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  30.25 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  30.4 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  23.65 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  28.97 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  27.43 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  24.04 
 
 
227 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  21.83 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  26.34 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  25 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  23 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  28.97 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  28.97 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  28.97 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  28.04 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  21.83 
 
 
206 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  24.06 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  21.13 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  24.3 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  25.47 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  22.22 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  21.54 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  25.27 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  29.6 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  26.02 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  20.92 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  21.95 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>