193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2253 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
245 aa  504  1e-142  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.01453e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.5 
 
 
210 aa  216  3e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.14 
 
 
245 aa  208  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.49 
 
 
241 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  45.33 
 
 
262 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  45.33 
 
 
262 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.98 
 
 
242 aa  200  2e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.75 
 
 
241 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  47.64 
 
 
263 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  40.17 
 
 
245 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.77 
 
 
242 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.5 
 
 
241 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.26 
 
 
241 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.27 
 
 
241 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.27 
 
 
241 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  42.99 
 
 
265 aa  189  3e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.07 
 
 
241 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  45.54 
 
 
244 aa  188  6e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.27 
 
 
241 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.18 
 
 
242 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 
241 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 
241 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 
241 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.06 
 
 
241 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.19 
 
 
242 aa  184  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  2.86403e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  43.61 
 
 
238 aa  184  1e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.98401e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  42.41 
 
 
241 aa  182  4e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.47 
 
 
261 aa  182  4e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.35 
 
 
251 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.91 
 
 
240 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.74 
 
 
251 aa  174  2e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.86 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  37.71 
 
 
236 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.71 
 
 
236 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.71 
 
 
236 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.71 
 
 
236 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.71 
 
 
236 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  37.71 
 
 
236 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  37.71 
 
 
236 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.29 
 
 
236 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.29 
 
 
236 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  39.66 
 
 
244 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
264 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  40.18 
 
 
246 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  38.16 
 
 
237 aa  165  6e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.62 
 
 
246 aa  164  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.5 
 
 
242 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  5.49688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.51 
 
 
238 aa  162  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.51 
 
 
238 aa  162  4e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.51 
 
 
238 aa  162  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.1 
 
 
238 aa  162  5e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  34.96 
 
 
258 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
239 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  42.93 
 
 
243 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.87 
 
 
253 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.87 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.38 
 
 
247 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.38 
 
 
247 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.24 
 
 
242 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.2 
 
 
264 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.19 
 
 
238 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  34.5 
 
 
254 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.19 
 
 
238 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.76 
 
 
238 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  35.62 
 
 
232 aa  152  6e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  33.33 
 
 
272 aa  140  2e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.92 
 
 
245 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.51 
 
 
262 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.03 
 
 
250 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  33.8 
 
 
252 aa  133  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  33.18 
 
 
249 aa  131  1e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  34.4 
 
 
285 aa  130  2e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  35.65 
 
 
248 aa  130  2e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.75 
 
 
236 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  36.76 
 
 
277 aa  128  1e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  32.06 
 
 
255 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  33.8 
 
 
248 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  33.8 
 
 
248 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  34.47 
 
 
285 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  30.1 
 
 
238 aa  120  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.7 
 
 
237 aa  119  5e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  29 
 
 
237 aa  119  5e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  38.46 
 
 
179 aa  118  8e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  32.27 
 
 
246 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  29.03 
 
 
239 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.04 
 
 
272 aa  108  7e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.62 
 
 
237 aa  108  8e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.91 
 
 
241 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.33 
 
 
240 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.86 
 
 
236 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.19 
 
 
247 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  26.86 
 
 
236 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  29.58 
 
 
238 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.14 
 
 
241 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.23 
 
 
246 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>