More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2250 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
472 aa  956    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
465 aa  505  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
465 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
468 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
477 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
466 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
508 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
475 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
485 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
478 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
485 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
481 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
490 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
488 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
488 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
482 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
485 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.68 
 
 
546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
464 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
469 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
486 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
484 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
484 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
484 aa  306  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.8 
 
 
518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
504 aa  302  7.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
463 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.37 
 
 
495 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.13 
 
 
445 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
491 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
469 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
498 aa  300  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
466 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
494 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
467 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
535 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
467 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
488 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
469 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
472 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
469 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
464 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
469 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
470 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
467 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
466 aa  292  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
504 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
504 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
463 aa  292  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
471 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
471 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
449 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
504 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
495 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
466 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
463 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
466 aa  290  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
469 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
490 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
490 aa  290  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
471 aa  289  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
471 aa  289  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  289  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
471 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
464 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
471 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
469 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
449 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>