More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2216 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  66.15 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  66.93 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  64.34 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  60.72 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  60.47 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  58.91 
 
 		 388 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  62.95 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  58.14 
 
 		 388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  59.17 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  59.69 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  59.69 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  59.43 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  59.69 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  58.66 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  58.55 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  54.78 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.36 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  38.68 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  36.75 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  32.55 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  35.51 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  33.24 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  30.71 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 454 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.07 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  25.77 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  28.71 
 
 		 650 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29.01 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.75 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.82 
 
 		 640 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  26.15 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  24.82 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.42 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  29.7 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  32.16 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.25 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  28.29 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  27.17 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 		 654 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  26.25 
 
 		 654 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  26.3 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.12 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  30.45 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  27.55 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  29.24 
 
 		 649 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.67 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  36.94 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  22.89 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  29.24 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.19 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  35.81 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  22.57 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.12 
 
 		 696 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.36 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.24 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.7 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.68 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.88 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.78 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.88 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  28.09 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  22.84 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.99 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.69 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  28.52 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.42 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.21 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  27.91 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.41 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.12 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.82 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  35.66 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.9 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.57 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  36.52 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  33.75 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  36.52 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>