More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2214 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  73.52 
 
 
228 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  74.89 
 
 
234 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  73.42 
 
 
231 aa  334  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  73.06 
 
 
229 aa  327  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  74.67 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  71.49 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  72.6 
 
 
229 aa  325  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  71.69 
 
 
230 aa  315  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  69.23 
 
 
231 aa  314  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  67.73 
 
 
235 aa  307  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  71.95 
 
 
232 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  71.49 
 
 
232 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  71.95 
 
 
232 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  71.49 
 
 
232 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  71.95 
 
 
232 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  71.49 
 
 
232 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  66.51 
 
 
268 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  71.95 
 
 
232 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.09 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 
229 aa  278  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  61.54 
 
 
241 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  58.26 
 
 
231 aa  274  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  59.46 
 
 
240 aa  267  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  59.73 
 
 
232 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  54.55 
 
 
225 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  53.42 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  54.63 
 
 
234 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.95 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  51.15 
 
 
242 aa  224  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  50.45 
 
 
225 aa  221  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.37 
 
 
235 aa  221  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  50.45 
 
 
225 aa  221  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.81 
 
 
230 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  48.61 
 
 
256 aa  218  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.96 
 
 
240 aa  218  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 
240 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.61 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
228 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.02 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.25 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
226 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
246 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.02 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.42 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  48.42 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.29 
 
 
236 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 
224 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
236 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  47.47 
 
 
236 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.79 
 
 
266 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.13 
 
 
225 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
227 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.5 
 
 
226 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  43.52 
 
 
293 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  47.95 
 
 
227 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
248 aa  208  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.81 
 
 
238 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  208  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  49.08 
 
 
253 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
220 aa  207  9e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  42.36 
 
 
250 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
220 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  43.81 
 
 
244 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
224 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47 
 
 
230 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
228 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.42 
 
 
264 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.66 
 
 
239 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  47.06 
 
 
229 aa  205  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.5 
 
 
230 aa  205  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.7 
 
 
227 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.64 
 
 
235 aa  205  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
255 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  45.18 
 
 
229 aa  204  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  48.39 
 
 
241 aa  204  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47 
 
 
232 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.27 
 
 
238 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>