More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2178 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1256 aa  2582    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 
1287 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
1314 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
1312 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
746 aa  324  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
814 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  31.85 
 
 
1444 aa  296  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
1185 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  31.56 
 
 
1673 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
1317 aa  266  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
987 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
1035 aa  254  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  45.59 
 
 
723 aa  253  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 
995 aa  251  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
1059 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
1313 aa  243  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
1322 aa  240  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.11 
 
 
862 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
827 aa  192  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
852 aa  189  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
818 aa  182  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
850 aa  181  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
818 aa  180  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
953 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
1008 aa  142  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
1600 aa  141  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
1435 aa  129  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
785 aa  128  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
1523 aa  128  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  37.99 
 
 
229 aa  127  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
369 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
680 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 
1523 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  121  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
1162 aa  118  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 
746 aa  117  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  29 
 
 
353 aa  115  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  28.48 
 
 
543 aa  115  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
1268 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  27.51 
 
 
284 aa  106  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
457 aa  101  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
658 aa  98.6  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
1340 aa  98.2  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
624 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
280 aa  97.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
679 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
616 aa  95.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
996 aa  92.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.2 
 
 
1119 aa  92  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  91.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  91.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  91.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  29.46 
 
 
229 aa  91.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  30.36 
 
 
229 aa  90.9  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  30.36 
 
 
229 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
576 aa  90.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  29.02 
 
 
229 aa  89.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  30.45 
 
 
229 aa  89.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  29.91 
 
 
229 aa  89  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  24.86 
 
 
597 aa  88.2  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  30.91 
 
 
229 aa  88.2  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  34.16 
 
 
228 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
308 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
325 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.57 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
902 aa  85.1  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
1067 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
298 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
334 aa  84  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
337 aa  84  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  30.9 
 
 
199 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
1739 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  27.55 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
1359 aa  82.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
337 aa  82  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
602 aa  81.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
341 aa  81.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  29.96 
 
 
387 aa  81.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  32.93 
 
 
231 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
581 aa  80.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
270 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
337 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
342 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
617 aa  79  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
298 aa  79  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 
384 aa  79  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
1759 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.67 
 
 
2401 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
293 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
817 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
303 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
348 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
525 aa  76.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
310 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>