More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2176 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
455 aa  940    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42.44 
 
 
983 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  40.69 
 
 
708 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
307 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
307 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.71 
 
 
341 aa  117  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.89 
 
 
307 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
337 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
336 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
333 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  48.48 
 
 
334 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  33.19 
 
 
294 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
233 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.45 
 
 
332 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.74 
 
 
294 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 
302 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
581 aa  100  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
280 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
597 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
321 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  45.45 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
367 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
1177 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
1177 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  43.2 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
317 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  42 
 
 
251 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.76 
 
 
326 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
1035 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
277 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  46.46 
 
 
310 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 
324 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  38.52 
 
 
341 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
235 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
276 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.95 
 
 
326 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
294 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
305 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 
338 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
336 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
303 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
326 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 
663 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 
256 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
287 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
318 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
316 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  48.08 
 
 
317 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
235 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
347 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
760 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
297 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
337 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
319 aa  91.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.44 
 
 
367 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.75 
 
 
341 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
812 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
249 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
358 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.51 
 
 
321 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 
269 aa  90.1  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
352 aa  90.1  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
373 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
348 aa  90.1  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
305 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
276 aa  89.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 
244 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
315 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.51 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.58 
 
 
295 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
330 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 
727 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
347 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  26.32 
 
 
314 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
348 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
235 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
348 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
351 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.23 
 
 
326 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
746 aa  87.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
324 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
235 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
290 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
362 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
290 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
350 aa  87.4  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
325 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.9 
 
 
321 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
341 aa  86.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
321 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>